2024年10月22日，海南大学热带油茶团队赖杭桂教授与海南省林业科学研究院（海南省红树林研究院）林业研究所联合在植物科学领域国际期刊《Plants》（SCI Q1区）发表题为“Single Nucleotide Polymorphisms and Insertion/Deletion Variation Analysis of Octoploid and Decaploid Tropical Oil Tea Camellia Populations Based on Whole-Genome Resequencing”的研究论文。硕士研究生宋家明和赵欣为共同第一作者，赖杭桂教授和陈飞飞高级工程师为通讯作者。该论文揭示了不同倍性水平和地理区域的热带油茶种群之间的遗传多样性和差异性，为油茶的种质资源保护和基因改良提供了新的见解。

油茶（Camellia spp.）是一种重要的木本油料作物，具有很高的营养价值和经济价值。采用全基因组重测序技术（WGR）可以深入了解油茶的遗传背景，为油茶育种研究、种质资源保护和遗传改良提供参考。本研究选取了来自海南、广东和广西3个省份的5个热带地区油茶群体共49份个体油茶种质资源，利用流式细胞术确定样本倍性大小后，进行全基因组重测序分析。结果共获得了239,441,603个高质量SNPs和23,510,374个高质量InDels。分析发现，SNP和InDel在不同功能区域的分布存在明显差异，在基因间区和内含子等非编码区域变异密度较高，而在编码区域变异密度相对较低。转换是SNP变异的主要类型。群体遗传多样性分析表明，这些油茶群体具有较高的遗传多样性和广泛的遗传变异现象，其中海南地区的油茶群体遗传多样性高于内陆地区。    

研究结果表明，海南地区的油茶种群由于倍性和生态适应性的优势，具备良好的改良潜力，尤其适用于高效油料作物的开发与利用。这些发现为进一步研究油茶的生态适应性和抗逆性提供了理论依据，也为油茶的基因组育种和种质资源保护奠定了一定基础。

该论文主要参与作者包括海南大学张诗慧博士、黄东益教授、刘进平教授、胡海燕副教授、王健教授、吴文嫱副教授、黄小龙副教授。本研究得到中国国家重点研发计划、海南省省属科研院所科研项目和海南省重点研发项目的支持。

文章链接：https://doi.org/10.3390/plants13212955