转录组和代谢组作为组学技术大家做的比较多，但是你知道两者可以做哪些联合分析吗？今天给你细数一下！1. 相关性网络分析解析基因表达与代谢物积累的共变关系。基于Pearson/Spearman相关系数构建基因-代谢物互作网络，筛选显著关联节点。例：拟南芥盐胁迫研究中，MYB77转录因子表达与脯氨酸、甜菜碱代谢物显著正相关，揭示其通过渗透调节通路增强抗逆性。2. 多组学共表达模块挖掘识别基因-代谢物协同调控的功能模块。应用WGCNA整合数据，将共变基因簇与代谢物簇关联。例：番茄果实成熟模块中，RIN转录因子模块与类胡萝卜素代谢物簇共现，证实乙烯信号对色素合成的级联调控。3. 通路级整合映射系统解析基因调控对代谢通路的动态影响。将差异基因与差异代谢物映射至KEGG通路，识别转录-代谢协同扰动通路。例：青蒿萜类合成通路中，ADS和CYP71AV1基因表达与青蒿酸等代谢物同步上调，锁定萜类骨架合成的关键调控节点。4. 时间序列动态耦合分析揭示基因表达与代谢表型的时序调控关系。基于STEM或Mfuzz对时间序列数据进行聚类，识别基因-代谢物滞后响应模式。例：水稻开花过程中，Hd3a基因表达峰值较赤霉素代谢物提前3天，提示其作为开花信号“启动开关”的功能。5. 调控网络逆向推演从代谢表型反向预测上游调控基因。整合转录因子结合位点预测与代谢物含量数据，构建代谢物驱动的基因调控网络。例：茶树类黄酮合成中，MYB12靶基因表达与EGCG含量显著相关，验证其对儿茶素合成的转录调控作用。为了让大家能够掌握转录组和代谢组联合分析的基本原理和分析方法，
开班时间：2025年8月3日-8月5日，3天；上课方式：组学大讲堂网校直播
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课程内容及优势
优势1：内容丰富，本培训班包含的分析内容囊括绝大部分一区、二区该类文章的分析条目；
优势2：学习难度低，课程针对0基础学员设计，整理好数据，复制粘贴即可分析自己的数据；优势3：对个人电脑性能要求低，云服务器上教学，对电脑配置无要求，自己电脑仍可正常办公；优势4：售后无忧，2年超长时间售后答疑，学习全程无忧；优势5：出图颜值高，为满足广大研究者对“颜值”的追求，我们紧追最新文献中图表呈现的新趋势，不断尝试新的绘图R包和程序，生成了更炫并且信息量更多的图表，可以直接用于文章撰写。
直播课程内容
第一节：转录组分析原理与文献分析思路讲解1. 转录组整体分析流程与原理讲解2. 转录组文献分析思路讲解第二节：代谢组分析原理与文献分析思路讲解1. 代谢组整体分析流程与原理讲解2. 代谢组文献分析思路讲解第三节：转录组与代谢组结果讲解1. 转录组结果讲解（每张表，每张图的生物学意义讲解）2. 代谢组结果讲解（每张表，每张图的生物学意义讲解）第四节：R语言基础1. R语言简介2. R语言安装环境搭建与R扩展包安装3. 数据结构、数据读入与写出、逻辑判断，4. 常用方法介绍（平均，求和，方差，标准差，数据筛选等）第五节：R语言绘图基础（ggplot2）1. ggplot绘图基本思想（数据与图形的映射）2. 绘图举例（点、线、柱状图等）3. 绘图结果的美化（颜色，图形大小形状，标题，坐标轴，主题等的设置）4. 存储输出图片（尺寸设置符合杂志要求）第六节：差异表达分析结果绘图美化1. 基因表达差异箱线图绘制2. 差异基因火山图、多分组差异分析结果散点图绘制3. 多分组差异分析结果韦恩图（2-7维）、UpSet图（7维以上）绘制4. 所有样品主成分分析图绘制5. 所有样品相关性图绘制6. 差异基因表达量热图绘制
第七节：GO、KEGG富集分析结果美化（气泡图、条形图）1.差异表达基因GO富集分析气泡图绘制2.差异表达基因GO富集分析条形图绘制3.差异表达基因KEGG富集分析气泡图绘制
第八节：蛋白互作网络PPI分析1.Cytoscape安装与使用详解（点，线，颜色数据映射等）2.差异基因蛋白互作网络绘制
第九节：转录因子调控网络分析1.转录因子分析2.Cytoscape绘制基因与转录因子互作网络图
第十节：转录组与代谢组联合分析1.转录组与代谢组相关性分析2.相关性分析结果热图和气泡图绘制3.差异基因与差异代谢物载荷图与柱状图绘制4.转录组与代谢组KEGG富集分析5.差异基因与差异代谢物九象限图绘制
第十一节：重要基因设计qPCR引物验证1.引物设计（引物长度，GC含量，退火温度等）第十二节：原始数据上传NCBI数据库SRA1.SRA数据库（bioproject，biosample 等创建）2.数据准备与整理（样品信息表，测序数据文件表）3.上传数据到NCBI（aspera下载安装，高速批量上传）第十三节：WGCNA基因共表达网络分析1.WGCNA包做基因共表达网络分析原理讲解（重要参数）2.共表达模块识别3.模块基因与表型数据关联分析4.Hub基因筛选5.结果可视化
第十四节：时间序列数据聚类分析Mfuzz1.Mfuzz包分析基因表达模式2.聚类结果可视化3.相同表达模式基因GO KEGG功能富集分析
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常见问题解答
1. 集中3天培训是否可以学完这么多内容？答：经过多年课程优化，尽量合并操作环节，分析代码已经封装好，整理好数据，复制粘贴即可分析自己的数据，大大降低了分析难度，3天完全可以学完以上分析内容。2. 培训后提供回放吗？答：培训结束，不是学习的结束，课后可以获得对应线上录播视频课程，两年内不限次观看。分析所用软件、代码、课件、笔记均会提供，另外赠送组学大讲堂云服务器3个月的使用权限，学员课后仍可方便的进行练习。
3. 培训的时候是在云服务器上，如果换了设备，分析步骤还一样吗？答：组学大讲堂培训采用先进的docker虚拟机，无论在什么设备上，凡是使用我们提供的镜像，均可保持一致的操作环境，真正做到怎么学就怎么用。4. 能否提供发票？答：由北京组学生物科技有限公司提供正规发票。
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培训费用及优惠信息
原价：3280元/人，限时优惠2880元/人。优惠信息：① 团报优惠：2人及以上同时报名，额外优惠200元/人。② 赠送价值700元组学大讲堂云服务器3个月使用权；③ 已购买过组学大讲堂对应录播课程的学员，可以按实际购买价折现予以优惠。
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报名方式
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